74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4411 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 
759 aa  1479    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  83.33 
 
 
771 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  54.67 
 
 
665 aa  321  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  53.9 
 
 
639 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  53.52 
 
 
899 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  53.98 
 
 
495 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  56.64 
 
 
330 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  52.88 
 
 
343 aa  311  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  52.94 
 
 
364 aa  310  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  55.17 
 
 
698 aa  308  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  53.29 
 
 
388 aa  307  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  53.29 
 
 
388 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  53.29 
 
 
388 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  50.79 
 
 
362 aa  297  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  51.75 
 
 
418 aa  296  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  52.44 
 
 
405 aa  296  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  51.06 
 
 
478 aa  293  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  53.12 
 
 
619 aa  293  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  48.6 
 
 
346 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  40.97 
 
 
453 aa  217  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  40.62 
 
 
416 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  40.62 
 
 
455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  40.95 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  43 
 
 
412 aa  214  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.97 
 
 
552 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  40.31 
 
 
475 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  40.31 
 
 
475 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  40.31 
 
 
475 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  39.22 
 
 
587 aa  193  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  34.97 
 
 
414 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  39.26 
 
 
666 aa  173  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  35.79 
 
 
425 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  36.46 
 
 
1160 aa  164  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  35.79 
 
 
390 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  37.19 
 
 
532 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  34.25 
 
 
926 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  34.22 
 
 
1132 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  36.58 
 
 
968 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  37.41 
 
 
319 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  37.41 
 
 
319 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  37.41 
 
 
319 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  33.68 
 
 
1519 aa  144  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  38.03 
 
 
390 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  36.27 
 
 
380 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  32.42 
 
 
811 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.66 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  35.02 
 
 
534 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  30.57 
 
 
586 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  30.86 
 
 
533 aa  127  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  35.12 
 
 
439 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
617 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  30.39 
 
 
544 aa  119  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  32.16 
 
 
341 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  33.46 
 
 
474 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 
487 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.45 
 
 
334 aa  97.8  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  29.97 
 
 
579 aa  90.5  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.16 
 
 
659 aa  88.2  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  26.05 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  27.68 
 
 
497 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  26.04 
 
 
494 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  26.39 
 
 
485 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  32.67 
 
 
550 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 
270 aa  50.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.14 
 
 
350 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  29.03 
 
 
544 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.37 
 
 
400 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
282 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7293  hypothetical protein  25.8 
 
 
1095 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.56 
 
 
253 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  32.34 
 
 
252 aa  45.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.38 
 
 
288 aa  45.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  26.5 
 
 
400 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
263 aa  44.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>