180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4394 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  100 
 
 		 282 aa  541  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0179  HAD family hydrolase  78.6 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183714  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  48.34 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  50.55 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0794  trehalose-phosphatase  53.03 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  48.43 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  48.68 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3989  HAD family hydrolase  43.7 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0099  HAD family hydrolase  41.95 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  27.46 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  37.74 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0864  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5832  trehalose-phosphatase  31.58 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  36.67 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2971  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4324  trehalose-phosphatase  29.6 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.0213832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  31.69 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  34.73 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.83 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.52 
 
 		 733 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.36 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.44 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.52 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  35.19 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  30.36 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  33.65 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  33.78 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  34.45 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  32.39 
 
 		 847 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  30.92 
 
 		 744 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  29.1 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  34.83 
 
 		 842 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  32.24 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  33.82 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  31.69 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  33.19 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  33.8 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.39 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1363  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  32.85 
 
 		 751 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.475191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0598  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.16 
 
 		 735 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.289814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0450  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  34.55 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2216  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.53 
 
 		 752 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  35.59 
 
 		 867 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.98 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.98 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  33.33 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.75 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  31.02 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  33.61 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  34.58 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  33.33 
 
 		 723 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  30 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 867 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.93 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  35.1 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.5 
 
 		 745 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.76 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  29.6 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1968  trehalose-phosphatase  29.82 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  31.25 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  30.42 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  30.58 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  30.58 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  31.25 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  33.33 
 
 		 844 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.42 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  30.42 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.02 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.72 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  30.92 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4022  trehalose-phosphatase  26.89 
 
 		 724 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179404  normal  0.381996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.34 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.55 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  30.2 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  30.77 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02610  trehalose-phosphatase, putative  28.02 
 
 		 989 aa  62.4  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.114817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>