More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4348 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  100 
 
 
253 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  70.97 
 
 
268 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.16 
 
 
244 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.11 
 
 
251 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  59.67 
 
 
263 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.67 
 
 
263 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.26 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.29 
 
 
244 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.43 
 
 
254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  57.49 
 
 
262 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.07 
 
 
248 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.32 
 
 
238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  55.65 
 
 
1088 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.33 
 
 
236 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  57.2 
 
 
249 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.84 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.89 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.63 
 
 
243 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.7 
 
 
525 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.52 
 
 
1314 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.72 
 
 
250 aa  221  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.96 
 
 
1055 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.99 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.96 
 
 
1051 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.19 
 
 
1053 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.11 
 
 
1053 aa  214  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.68 
 
 
1052 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.54 
 
 
313 aa  211  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.49 
 
 
1051 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.2 
 
 
252 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.75 
 
 
262 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.01 
 
 
240 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.64 
 
 
1050 aa  199  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.51 
 
 
257 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
252 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
248 aa  188  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.76 
 
 
258 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.88 
 
 
1053 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.03 
 
 
246 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.53 
 
 
250 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.7 
 
 
1125 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  37.34 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.08 
 
 
223 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  35.84 
 
 
1327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.11 
 
 
214 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.19 
 
 
216 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  32.35 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.22 
 
 
219 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  33.91 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  35.51 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.22 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  33.59 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.91 
 
 
207 aa  91.7  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.77 
 
 
242 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.19 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  33.92 
 
 
208 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.67 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.2 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
978 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.22 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.47 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.73 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.06 
 
 
965 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  28.64 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.35 
 
 
456 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  29.47 
 
 
219 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.33 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  29.55 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  29.61 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.24 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  26.86 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.52 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.33 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  26.63 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  27.48 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.01 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  28 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  26.95 
 
 
456 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  27.88 
 
 
219 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.47 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  30.29 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.92 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.48 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  30.99 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  33.62 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30.24 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  27.4 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  27.4 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  28.21 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  27.4 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>