127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4347 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  59.49 
 
 		 784 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  62.36 
 
 		 824 aa  955    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 804 aa  1633    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  59.72 
 
 		 787 aa  903    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  55.68 
 
 		 786 aa  881    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  66.84 
 
 		 810 aa  1014    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  47.22 
 
 		 777 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  59.72 
 
 		 787 aa  903    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  60.51 
 
 		 794 aa  942    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  56.28 
 
 		 787 aa  819    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  65.34 
 
 		 784 aa  1016    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  59.72 
 
 		 787 aa  903    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  60.18 
 
 		 789 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  62.99 
 
 		 791 aa  986    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  58.58 
 
 		 786 aa  871    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  59.04 
 
 		 790 aa  912    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  51.44 
 
 		 780 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  81.43 
 
 		 800 aa  1300    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  63.37 
 
 		 791 aa  967    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  62.94 
 
 		 786 aa  934    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  61.71 
 
 		 807 aa  983    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  45.11 
 
 		 795 aa  622  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  44.42 
 
 		 795 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  44.01 
 
 		 795 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  43.01 
 
 		 790 aa  598  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  42.61 
 
 		 790 aa  594  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  40.43 
 
 		 825 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  40.15 
 
 		 843 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  43.9 
 
 		 782 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  41.27 
 
 		 848 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  42.05 
 
 		 834 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  40.66 
 
 		 858 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  37.6 
 
 		 780 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  36.52 
 
 		 781 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  34.93 
 
 		 778 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  33.64 
 
 		 780 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  37.25 
 
 		 767 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  37.77 
 
 		 781 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  34.7 
 
 		 788 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  36.26 
 
 		 786 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  35.32 
 
 		 778 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  32.35 
 
 		 789 aa  429  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  35.67 
 
 		 986 aa  376  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  29.65 
 
 		 780 aa  319  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  27.52 
 
 		 805 aa  318  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  30 
 
 		 751 aa  316  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  30 
 
 		 774 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  29.74 
 
 		 710 aa  313  7.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  28.1 
 
 		 767 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  29.86 
 
 		 771 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  28.1 
 
 		 750 aa  303  8.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  27.26 
 
 		 765 aa  301  4e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  29.71 
 
 		 748 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  31.67 
 
 		 761 aa  300  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.23 
 
 		 778 aa  300  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.02 
 
 		 759 aa  299  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.96 
 
 		 768 aa  298  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  31.4 
 
 		 761 aa  294  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 978 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  26.75 
 
 		 763 aa  289  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  28.94 
 
 		 755 aa  290  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  28.1 
 
 		 965 aa  287  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.18 
 
 		 749 aa  282  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  29.68 
 
 		 757 aa  281  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 759 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 		 720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.75 
 
 		 762 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  27.9 
 
 		 775 aa  267  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  26.33 
 
 		 758 aa  266  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  27.38 
 
 		 789 aa  266  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  29.26 
 
 		 755 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  29.26 
 
 		 755 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  29.12 
 
 		 755 aa  263  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  29.26 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  29.26 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  29.26 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  26.89 
 
 		 787 aa  259  9e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  35.2 
 
 		 760 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  28.7 
 
 		 755 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  28.65 
 
 		 755 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  26.6 
 
 		 807 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  28.3 
 
 		 752 aa  251  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  28.33 
 
 		 752 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  26.77 
 
 		 787 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  36.66 
 
 		 777 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  26.79 
 
 		 781 aa  245  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  26.47 
 
 		 794 aa  232  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  28.55 
 
 		 776 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  25.7 
 
 		 769 aa  226  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  25.16 
 
 		 753 aa  224  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  34.33 
 
 		 704 aa  221  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.79 
 
 		 807 aa  216  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  25.42 
 
 		 748 aa  207  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.35 
 
 		 1088 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  24.86 
 
 		 756 aa  193  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.56 
 
 		 1052 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.37 
 
 		 807 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.48 
 
 		 794 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.06 
 
 		 1051 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.62 
 
 		 1053 aa  190  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>