More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4315 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  100 
 
 
217 aa  437  1e-122  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  89.55 
 
 
257 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 
234 aa  279  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  69.27 
 
 
216 aa  279  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  70.65 
 
 
210 aa  275  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  70.59 
 
 
194 aa  272  2e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  70.83 
 
 
193 aa  269  3e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  68.72 
 
 
200 aa  264  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  71.04 
 
 
206 aa  263  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  66.83 
 
 
202 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  65.5 
 
 
198 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  66.82 
 
 
220 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  69.52 
 
 
199 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  70.05 
 
 
202 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  70.05 
 
 
202 aa  261  5e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  67.54 
 
 
201 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  68.98 
 
 
207 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  67.54 
 
 
201 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  67.54 
 
 
201 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  63.13 
 
 
219 aa  258  5e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 
202 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  69.02 
 
 
219 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  66.83 
 
 
205 aa  254  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  62.32 
 
 
214 aa  253  1e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  65.76 
 
 
206 aa  253  2e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  64.8 
 
 
200 aa  252  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  60.09 
 
 
209 aa  251  5e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  66.13 
 
 
198 aa  249  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  59.81 
 
 
219 aa  248  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  66.84 
 
 
222 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 
219 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 
214 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  65.95 
 
 
195 aa  244  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  65.05 
 
 
189 aa  243  1e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  67.21 
 
 
200 aa  243  1e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 
214 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 
205 aa  240  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  63.59 
 
 
185 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  63.24 
 
 
187 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  61.58 
 
 
195 aa  233  1e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  60.87 
 
 
188 aa  234  1e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  64.13 
 
 
190 aa  233  1e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  60.32 
 
 
194 aa  224  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  64.52 
 
 
188 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.52 
 
 
239 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.52 
 
 
239 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 
186 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 
189 aa  222  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  59.24 
 
 
185 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.39263e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 
189 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
188 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  60.73 
 
 
199 aa  220  1e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 
235 aa  220  1e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  59.02 
 
 
188 aa  219  2e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.14147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 
188 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  55.88 
 
 
227 aa  218  4e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  52.94 
 
 
189 aa  218  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 
247 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  58.7 
 
 
187 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.28412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  58.15 
 
 
188 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.76289e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  62.03 
 
 
195 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 
192 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
213 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  59.12 
 
 
189 aa  215  3e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.00048e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.62982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
189 aa  216  3e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
187 aa  215  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  61.33 
 
 
219 aa  214  1e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  59.14 
 
 
207 aa  213  2e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
235 aa  213  3e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  61.45 
 
 
220 aa  211  6e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  58.2 
 
 
218 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  58.89 
 
 
223 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
185 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
185 aa  208  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 
243 aa  208  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  59.44 
 
 
235 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 
206 aa  207  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 
219 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 
218 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 
214 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 
214 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 
223 aa  204  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 
226 aa  203  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  56.02 
 
 
216 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  57.07 
 
 
198 aa  201  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.42 
 
 
216 aa  200  1e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  52.5 
 
 
212 aa  198  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 
213 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 
213 aa  197  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  52.46 
 
 
190 aa  197  1e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  59.52 
 
 
195 aa  196  2e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>