More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4293 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 304 aa  603  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  75.17 
 
 		 349 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  62.03 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  60.27 
 
 		 307 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  59.12 
 
 		 301 aa  348  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  59.2 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  60.6 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  54.46 
 
 		 299 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  56.81 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  56.62 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  59.15 
 
 		 313 aa  325  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  57.81 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  56.72 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  57.58 
 
 		 494 aa  315  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  54.82 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  52.7 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  45.51 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  45.9 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  50.66 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  46.03 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  47.67 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  43.12 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  44.97 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  43.51 
 
 		 270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  42.18 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  38.85 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  44.18 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  37.8 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  38.65 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  50.64 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  57.02 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  32.32 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 		 273 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  32.38 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 351 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  33.22 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  39.49 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.63 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  35.34 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.86 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  35.22 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>