More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4284 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  100 
 
 		 289 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  70.67 
 
 		 259 aa  338  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  60.28 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  55.17 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  52.14 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  50.88 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  49.64 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  51.09 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  50.17 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  48.24 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  49.47 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  54.15 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  50.36 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  52.82 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  51.61 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  47.16 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  51.45 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  52.48 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.74 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  47.04 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.87 
 
 		 258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  47.46 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  41.24 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  41.49 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  39.07 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  43.99 
 
 		 253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  31.56 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  35.49 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  30.98 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.81 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  31.17 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  29.75 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  31.33 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  30.67 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  30.72 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  33.11 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 310 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  32.85 
 
 		 566 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  30.79 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  30.8 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 544 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  33.77 
 
 		 550 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 568 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  29.76 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 568 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 545 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  31.74 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 559 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 556 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 557 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 562 aa  89.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  33.45 
 
 		 566 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.66 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  30.41 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  28.81 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.37 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  28.4 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  27.73 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  34.4 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.14 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.75 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02190  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 549 aa  62.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.464356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>