14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4271 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4271  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000446812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1140  hypothetical protein  63.71 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.180925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6310  plasmid replication, integration and excision activator  60.14 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.370605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5329  hypothetical protein  58.39 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0343957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5541  plasmid replication, integration and excision activator  59.85 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1026  hypothetical protein  58.39 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5525  hypothetical protein  61.29 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5287  hypothetical protein  52.9 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0153  hypothetical protein  51.08 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8555  hypothetical protein  55.12 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149601  hitchhiker  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0698  hypothetical protein  50.81 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.353371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0045  hypothetical protein  43.36 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6359  hypothetical protein  42.75 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0918  hypothetical protein  36.81 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>