More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4262 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4262  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  93.8 
 
 		 258 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  80.62 
 
 		 258 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0872  phosphate transporter ATP-binding protein  79.46 
 
 		 258 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  75.19 
 
 		 258 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8263  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.97 
 
 		 258 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4978  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  76.45 
 
 		 259 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2743  phosphate ABC transporter permease  76.45 
 
 		 259 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00299446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0205  phosphate transporter ATP-binding protein  74.13 
 
 		 259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4651  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.13 
 
 		 259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4899  phosphate transporter ATP-binding protein  77.91 
 
 		 258 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1664  phosphate transporter ATP-binding protein  76.74 
 
 		 258 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4516  phosphate transporter ATP-binding protein  77.91 
 
 		 258 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4603  phosphate transporter ATP-binding protein  77.91 
 
 		 258 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.13 
 
 		 259 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2936  phosphate ABC transporter ATPase subunit  74.03 
 
 		 258 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0365  phosphate transporter ATP-binding protein  73.36 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3423  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.13 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.75 
 
 		 259 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0661  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.75 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493036  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5089  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  76.74 
 
 		 256 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2965  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.59 
 
 		 262 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6818  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  76.36 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.988375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01640  PstB  69.5 
 
 		 259 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31840  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 259 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2961  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.81 
 
 		 259 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10835  phosphate transporter ATP-binding protein  74.42 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3540  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.26 
 
 		 258 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4260  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.04 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  71.81 
 
 		 259 aa  387  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0224  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 259 aa  384  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3923  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.42 
 
 		 258 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06970  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  70.38 
 
 		 259 aa  381  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1069  phosphate transporter ATp-binding protein  69.88 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0094  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.93 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25590  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  69.02 
 
 		 261 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2740  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.86 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.37643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0653  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.88 
 
 		 282 aa  349  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0821  phosphate ABC transporter permease  64.96 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.53 
 
 		 267 aa  341  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.14 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.98 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.96 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  63.18 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.92 
 
 		 253 aa  337  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.63 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.04 
 
 		 286 aa  333  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1905  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.24 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.85 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.24 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2972  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  60.62 
 
 		 253 aa  328  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 251 aa  327  9e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 		 252 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 265 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.57 
 
 		 252 aa  324  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  59.77 
 
 		 255 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.77 
 
 		 255 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 		 256 aa  323  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  61.81 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4149  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.72 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.754485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 255 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2214  phosphate ABC transporter ATPase subunit  59.53 
 
 		 304 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.75 
 
 		 288 aa  321  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 281 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.75 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2704  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 		 252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.78 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.9 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  60.39 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.91 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 253 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  61.02 
 
 		 285 aa  318  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  60.39 
 
 		 262 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  60.39 
 
 		 262 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.91 
 
 		 251 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  60.55 
 
 		 265 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  60.55 
 
 		 272 aa  317  9e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  60.23 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.53 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 		 265 aa  317  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.53 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 292 aa  316  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2807  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.69 
 
 		 268 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.377161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>