More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4244 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 549 aa  1112    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4118  formylmethionine deformylase  56.19 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4540  XRE family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129106  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  38.31 
 
 		 175 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  35.03 
 
 		 155 aa  93.6  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  34.39 
 
 		 155 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  33.54 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  33.53 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  32.93 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  30.72 
 
 		 159 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  31.82 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  35.29 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  32.26 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  33.93 
 
 		 185 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  30.81 
 
 		 182 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  32.53 
 
 		 185 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  33.33 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  35.58 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  35.2 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  31.58 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  31.36 
 
 		 169 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  30.32 
 
 		 187 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  33.52 
 
 		 217 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  31.9 
 
 		 188 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  30.95 
 
 		 188 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  32.9 
 
 		 170 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  31.11 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  31.03 
 
 		 179 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  33.59 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  31.33 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  33.6 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  32.68 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  31.13 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  32.68 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  36.36 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  29.34 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  35.71 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  30.77 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  35.33 
 
 		 201 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  33.54 
 
 		 189 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  30.41 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  40.37 
 
 		 174 aa  73.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  34.21 
 
 		 188 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  32.74 
 
 		 191 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  36.36 
 
 		 177 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.84 
 
 		 179 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  32.48 
 
 		 154 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  32.56 
 
 		 176 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  33.13 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  30.07 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  30.97 
 
 		 154 aa  72  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  34.62 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  31.33 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  30.86 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0246  peptide deformylase  34.57 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  38.66 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  31.9 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  32.28 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  30.67 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  31.29 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  31.29 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  29.52 
 
 		 186 aa  69.7  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  30.67 
 
 		 184 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  30.67 
 
 		 184 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  30.67 
 
 		 184 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  30.67 
 
 		 184 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  30.67 
 
 		 184 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  33.33 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  31.33 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  34.73 
 
 		 177 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  32.12 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0781  peptide deformylase  35.09 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  30.06 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  28.87 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  31.85 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  30.82 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  33.12 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  31.85 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  34.39 
 
 		 170 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  38.83 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  29.41 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  32.3 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  30.57 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  36.64 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  27.43 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  31.17 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  33.33 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  28.3 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  32.53 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  35.61 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>