275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4212 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  100 
 
 		 284 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  69.04 
 
 		 511 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  61.09 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.46 
 
 		 501 aa  148  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.89 
 
 		 518 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.89 
 
 		 518 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.94 
 
 		 361 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.79 
 
 		 546 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.44 
 
 		 545 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.88 
 
 		 509 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.79 
 
 		 546 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.44 
 
 		 545 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.44 
 
 		 545 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  39.55 
 
 		 399 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.86 
 
 		 536 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.21 
 
 		 549 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.44 
 
 		 562 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.82 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.61 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.7 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.7 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.7 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.05 
 
 		 518 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.22 
 
 		 570 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  25.52 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  31 
 
 		 539 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  40.72 
 
 		 229 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.92 
 
 		 391 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.92 
 
 		 391 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.07 
 
 		 391 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  28.76 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  28.76 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  28.76 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  28.76 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.08 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1566  hypothetical protein  29.01 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0649  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2445  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.08593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1314  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2410  hypothetical protein  29.61 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3286  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0608  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0565  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.03 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0197  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1106  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1124  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2905  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1607  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2909  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0389  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241503  normal  0.900463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0885  transposase TnpA  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0888  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.17 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  35.4 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.17 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0223  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.66 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2875  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.6 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3299  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0613  ISBma1, transposase  30.41 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1512  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1863  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1934  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2090  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  30.41 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1917  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00988303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0456  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3524  ISBma1, transposase  30.41 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2448  transposase  30.41 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3176  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0382  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3471  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1099  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1119  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2202  isrso15-transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0180  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.017513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1101  ISBma1, transposase  30.88 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>