57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4193 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4193  transposase  100 
 
 		 122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  84.8 
 
 		 353 aa  217  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  83.2 
 
 		 509 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  92.77 
 
 		 83 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.83 
 
 		 511 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.32 
 
 		 546 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.32 
 
 		 546 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.66 
 
 		 520 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7030  transposase  60.49 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  47.06 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.54 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  38.76 
 
 		 280 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  37.04 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.07 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.92 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40 
 
 		 518 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40 
 
 		 518 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  31.15 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  40 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.03 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.03 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.03 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.03 
 
 		 545 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.03 
 
 		 545 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.03 
 
 		 545 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  36 
 
 		 539 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.79 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 		 549 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36 
 
 		 441 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  30.84 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.56 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  41.51 
 
 		 418 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  41.51 
 
 		 418 aa  50.8  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  41.51 
 
 		 418 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  41.51 
 
 		 418 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0015  transposase  35.85 
 
 		 299 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  41.51 
 
 		 442 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3979  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.18 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271598  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.67 
 
 		 536 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4509  insertion element is466s transposase  55 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.58 
 
 		 570 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1595  transposase  27 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0249  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1437  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.12833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0984  transposase  48.78 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000283789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1268  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.67 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1442  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.67 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2965  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.67 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3166  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.67 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3284  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.67 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3937  hypothetical protein  30.26 
 
 		 124 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>