259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4155 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  100 
 
 
396 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  100 
 
 
396 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  100 
 
 
396 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  99.75 
 
 
396 aa  791    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  100 
 
 
396 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  100 
 
 
396 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  67.57 
 
 
404 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1235  transposase, IS4  56.52 
 
 
414 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.227472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  43.28 
 
 
395 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  36.25 
 
 
437 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  34.8 
 
 
415 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  35.71 
 
 
433 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  35.71 
 
 
409 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  38.59 
 
 
390 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  38.59 
 
 
390 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  38.59 
 
 
390 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  34.06 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  34.06 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  31.04 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  31.23 
 
 
367 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  30.49 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  36.9 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  29.55 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  36.42 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  37.85 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0593  transposase IS4 family protein  32.77 
 
 
287 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  32.07 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  32.07 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  32.07 
 
 
372 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  31.22 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>