237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4097 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  55.74 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  49.04 
 
 		 319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  43.13 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  42.43 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  42.14 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  40.32 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 644 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  34.08 
 
 		 637 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.43 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.08 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.52 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  34.04 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.54 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  32.98 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  29.63 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.38 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.12 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  31.38 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.8 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.86 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.86 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.6 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  29.8 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 342 aa  85.9  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  31.47 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.09 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  22.82 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.18 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.28 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>