263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4081 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  100 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  94.55 
 
 
236 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  94.74 
 
 
237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  93.3 
 
 
237 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  81 
 
 
236 aa  363  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  83.26 
 
 
236 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  82.86 
 
 
262 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  79.29 
 
 
213 aa  321  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  79.8 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  77.78 
 
 
212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  91.93 
 
 
211 aa  298  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  81.56 
 
 
250 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  78.31 
 
 
228 aa  268  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  76.25 
 
 
175 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  79.87 
 
 
175 aa  232  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  79.22 
 
 
169 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  85.47 
 
 
135 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  38.6 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  40.65 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  39.32 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  42.18 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  38.05 
 
 
235 aa  158  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  40.19 
 
 
218 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  37.56 
 
 
235 aa  154  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  41.58 
 
 
263 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  42.42 
 
 
236 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  39.05 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  41.09 
 
 
341 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  39.51 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  41.41 
 
 
238 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  40 
 
 
254 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  40 
 
 
254 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  40 
 
 
264 aa  151  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  38.57 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  37.61 
 
 
240 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  40.28 
 
 
255 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  37.61 
 
 
234 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  37.61 
 
 
240 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  39.51 
 
 
238 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  38.57 
 
 
235 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  35.24 
 
 
235 aa  147  9e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  41.36 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  40.31 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  39.09 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  36.57 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  38.99 
 
 
228 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  38.99 
 
 
228 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  38.1 
 
 
228 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  38.53 
 
 
228 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  41.84 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  39.47 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.18 
 
 
230 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.18 
 
 
230 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  33.18 
 
 
230 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  33.18 
 
 
230 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  44.81 
 
 
250 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  43.72 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.96 
 
 
319 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.93 
 
 
226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  34.93 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  37.87 
 
 
214 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  38.46 
 
 
224 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  40.35 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  40.35 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.45 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  40.35 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  36.1 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  38.46 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  38.46 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  37.68 
 
 
250 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  37.68 
 
 
250 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  38.46 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.72 
 
 
346 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  38.46 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  39.05 
 
 
221 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  39.05 
 
 
224 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>