56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3984 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  100 
 
 		 135 aa  264  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  73.33 
 
 		 135 aa  189  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  61.94 
 
 		 136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  62.41 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  66.15 
 
 		 133 aa  156  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  59.26 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  62.22 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  62.79 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  56.82 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  59.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  58.21 
 
 		 133 aa  143  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  57.58 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  55.88 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  60.63 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 134 aa  133  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  51.94 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  53.38 
 
 		 136 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  51.88 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  53.08 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  51.88 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  56.06 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  53.78 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  51.54 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  53.44 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  57.6 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  31.3 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  47.92 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  28.57 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  39.68 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  34.92 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  36.23 
 
 		 452 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 66 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  31.82 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  33.87 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  31.82 
 
 		 260 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  36.51 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 267 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  37.88 
 
 		 143 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  34.48 
 
 		 374 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  33.33 
 
 		 69 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 278 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>