More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3979 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
527 aa  1007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.47 
 
 
763 aa  562  1e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.9 
 
 
487 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.04 
 
 
493 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.4 
 
 
498 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  44.95 
 
 
490 aa  315  1e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.84 
 
 
487 aa  312  8e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.7 
 
 
534 aa  311  3e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.85 
 
 
508 aa  308  2e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.42 
 
 
490 aa  304  2e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.92 
 
 
553 aa  303  6e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.53 
 
 
487 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.95 
 
 
489 aa  299  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.51 
 
 
519 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  42.39 
 
 
475 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43 
 
 
509 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
491 aa  287  3e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.31 
 
 
788 aa  287  3e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.51 
 
 
519 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.61 
 
 
487 aa  285  1e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.68 
 
 
1112 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  40.04 
 
 
494 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.1 
 
 
514 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 
522 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.02 
 
 
496 aa  276  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.12 
 
 
478 aa  275  2e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.49 
 
 
507 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 
479 aa  273  8e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 
479 aa  273  8e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 
506 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.24 
 
 
479 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.01 
 
 
487 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 
499 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.32 
 
 
482 aa  269  9e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.56 
 
 
505 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.05 
 
 
479 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
513 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.45 
 
 
506 aa  266  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
487 aa  266  9e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.27 
 
 
482 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.27 
 
 
482 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  41.04 
 
 
481 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 
501 aa  264  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.2 
 
 
474 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.44 
 
 
500 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  43 
 
 
482 aa  263  5e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  40.92 
 
 
492 aa  262  9e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.36 
 
 
479 aa  260  5e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.92 
 
 
497 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  41.29 
 
 
483 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.92 
 
 
512 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.65 
 
 
503 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  40.29 
 
 
492 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.84 
 
 
497 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  39.9 
 
 
481 aa  254  2e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 
485 aa  254  2e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 
501 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  44.24 
 
 
505 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  40.91 
 
 
477 aa  253  5e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  37.2 
 
 
470 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  39.61 
 
 
470 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  7.00007e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  39.46 
 
 
496 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  38.88 
 
 
498 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.55 
 
 
478 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 
489 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 
467 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
486 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.4 
 
 
504 aa  246  7e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.65 
 
 
502 aa  246  7e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
528 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
478 aa  244  2e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.2 
 
 
476 aa  245  2e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  42.2 
 
 
481 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  38.88 
 
 
489 aa  243  4e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 
469 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.42 
 
 
548 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 
488 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  40.94 
 
 
471 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  42.76 
 
 
480 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.61 
 
 
510 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 
480 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 
480 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  39.87 
 
 
454 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  44.47 
 
 
480 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.57 
 
 
469 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.23 
 
 
480 aa  241  3e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.23 
 
 
480 aa  241  3e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.23 
 
 
480 aa  241  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.23 
 
 
480 aa  241  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  42.55 
 
 
480 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.55 
 
 
480 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.61 
 
 
481 aa  239  7e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 
502 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  42.58 
 
 
480 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.5 
 
 
498 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 
518 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.97 
 
 
480 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
511 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.96 
 
 
757 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.52 
 
 
489 aa  237  5e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>