156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3900 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  58.2 
 
 
665 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  60.76 
 
 
662 aa  749    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1326    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  54.07 
 
 
658 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  57.5 
 
 
652 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  54.52 
 
 
699 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  78.93 
 
 
669 aa  996    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  55 
 
 
699 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  58.17 
 
 
667 aa  722    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  63.65 
 
 
703 aa  683    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  58.59 
 
 
657 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  62.89 
 
 
665 aa  715    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  55.7 
 
 
677 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  57.49 
 
 
682 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  53.24 
 
 
710 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  54.53 
 
 
664 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  54.53 
 
 
664 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  54.44 
 
 
673 aa  624  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  58.8 
 
 
682 aa  621  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  54.24 
 
 
664 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1103  protein of unknown function DUF255  56.08 
 
 
687 aa  601  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.491204  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  52.69 
 
 
656 aa  592  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  52.15 
 
 
696 aa  591  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  52.91 
 
 
667 aa  581  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  52.46 
 
 
673 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  46.01 
 
 
696 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  51.89 
 
 
596 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  45.28 
 
 
700 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  46.13 
 
 
685 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  42.65 
 
 
681 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  39.54 
 
 
686 aa  528  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  45.53 
 
 
666 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  43.89 
 
 
693 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  44.86 
 
 
678 aa  484  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  40.17 
 
 
699 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  46.3 
 
 
756 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  35.45 
 
 
686 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  37.77 
 
 
690 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  34.54 
 
 
686 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  36.8 
 
 
680 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  36.78 
 
 
711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  38.54 
 
 
699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  42.38 
 
 
694 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  38.3 
 
 
684 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  44.55 
 
 
669 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  43.37 
 
 
676 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  41.05 
 
 
700 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  42.55 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  36.62 
 
 
673 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  41.69 
 
 
665 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  41.24 
 
 
672 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  46.55 
 
 
718 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  40.47 
 
 
682 aa  432  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  41.56 
 
 
725 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  33.48 
 
 
675 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  39.71 
 
 
681 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  38.34 
 
 
669 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  37.55 
 
 
721 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  43.93 
 
 
718 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  46.77 
 
 
718 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  40.71 
 
 
673 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  34.78 
 
 
681 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  35.97 
 
 
680 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  38.03 
 
 
746 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.59 
 
 
691 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  36.54 
 
 
707 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  43.33 
 
 
676 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  34.31 
 
 
712 aa  416  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  40.39 
 
 
660 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  37.02 
 
 
711 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  33.05 
 
 
703 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  36.65 
 
 
700 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  34.54 
 
 
671 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  42.18 
 
 
706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  38.55 
 
 
676 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  40.09 
 
 
679 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  37.83 
 
 
750 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  37.91 
 
 
705 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  41.36 
 
 
700 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  35.89 
 
 
706 aa  405  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  39.48 
 
 
677 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  41.65 
 
 
680 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  38.7 
 
 
676 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  43.55 
 
 
715 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  35.56 
 
 
737 aa  399  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  36.33 
 
 
723 aa  393  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  37.62 
 
 
751 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  41.33 
 
 
744 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  34.38 
 
 
720 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  37.78 
 
 
722 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  37.66 
 
 
717 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  41.82 
 
 
715 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  39.68 
 
 
714 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  35.23 
 
 
720 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  37.27 
 
 
733 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  29.89 
 
 
687 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  37.97 
 
 
700 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  39.97 
 
 
641 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  35.34 
 
 
687 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  31.56 
 
 
681 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>