More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3852 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  64.04 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  58.73 
 
 		 284 aa  302  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  64.78 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  62.17 
 
 		 285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  60.53 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  59.13 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  56.58 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  55.6 
 
 		 266 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  53.28 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  51.56 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  49.13 
 
 		 410 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  48.47 
 
 		 410 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  47.39 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  36 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  33.9 
 
 		 476 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.5 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 476 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.74 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.48 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.53 
 
 		 809 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.21 
 
 		 382 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 414 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.27 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 374 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.93 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 378 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 430 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 335 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 420 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 305 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.55 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 307 aa  95.9  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 317 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 472 aa  95.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 227 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.54 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  31.22 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0922  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.27 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  32.33 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 336 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.13 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.89 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  27.23 
 
 		 502 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 344 aa  93.2  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.63 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 314 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 336 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.63 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.63 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 411 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 		 380 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 251 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  30.38 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 568 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.27 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.75 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 227 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  30.38 
 
 		 406 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 480 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 586 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>