More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3851 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
353 aa  703  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 
424 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
394 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
403 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
398 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
404 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.98 
 
 
384 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
435 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
401 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
390 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
391 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
410 aa  99.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
403 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
398 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.12 
 
 
413 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
392 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.04 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.11 
 
 
401 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 
382 aa  87  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
393 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
438 aa  85.9  1e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
413 aa  85.5  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  42.34 
 
 
398 aa  84.7  2e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25 
 
 
388 aa  84.7  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.67 
 
 
411 aa  85.1  2e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.27 
 
 
382 aa  84.3  3e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.09144e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
435 aa  83.2  7e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
452 aa  82.8  9e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
415 aa  82  2e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
356 aa  81.3  3e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
402 aa  80.5  4e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
369 aa  80.5  4e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
365 aa  79  1e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
445 aa  78.6  1e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  29.82 
 
 
396 aa  78.6  1e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
401 aa  79.3  1e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
462 aa  78.2  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
419 aa  78.6  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  43.56 
 
 
384 aa  78.6  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
373 aa  78.6  2e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  32.14 
 
 
371 aa  78.2  2e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
373 aa  77.8  3e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
405 aa  77.4  3e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
426 aa  77.4  3e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  46.81 
 
 
374 aa  77  4e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
405 aa  76.6  5e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
414 aa  76.3  8e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
441 aa  75.5  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.94 
 
 
412 aa  75.5  1e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
410 aa  75.5  1e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  28.11 
 
 
397 aa  75.9  1e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
428 aa  75.5  1e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
367 aa  75.9  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
419 aa  75.5  1e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  29.4 
 
 
409 aa  75.9  1e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 
433 aa  74.7  2e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 
397 aa  75.1  2e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
405 aa  75.1  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
439 aa  75.1  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  74.3  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
439 aa  74.3  3e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.41 
 
 
382 aa  74.3  3e-12  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  6.12209e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
378 aa  74.3  3e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
439 aa  74.3  3e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
409 aa  73.9  4e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
385 aa  73.6  4e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
439 aa  73.6  5e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.25 
 
 
396 aa  73.6  5e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
426 aa  73.6  5e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
415 aa  73.6  6e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
409 aa  73.2  6e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
507 aa  73.2  6e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
374 aa  73.2  6e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.57 
 
 
401 aa  73.2  6e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
409 aa  72.8  7e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
378 aa  73.2  7e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
392 aa  73.2  7e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
904 aa  72.8  8e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  40.19 
 
 
420 aa  72.8  8e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  40.19 
 
 
420 aa  72.8  8e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  24.85 
 
 
425 aa  72.8  8e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
414 aa  72.8  8e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
446 aa  72.8  9e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  1.95577e-05 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
391 aa  72.8  9e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
396 aa  72.8  9e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
428 aa  72.4  1e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  32.71 
 
 
350 aa  72  1e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
386 aa  72.4  1e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
387 aa  72.4  1e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
425 aa  72.4  1e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
418 aa  72.4  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>