298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3840 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  68.66 
 
 		 198 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  62.83 
 
 		 191 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  61.93 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  59.44 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  60 
 
 		 198 aa  194  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  57.65 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  57.65 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  57.65 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  52.05 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  54.92 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  60.54 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  56.33 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  53.01 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  57.5 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  50.29 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  51.43 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  49.71 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  49.69 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  44 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  45.24 
 
 		 193 aa  151  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  48.45 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  48.45 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  48.45 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  47.4 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  42.63 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  45.45 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  45.45 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  49.69 
 
 		 440 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  43.68 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  44.57 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.48 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  48.02 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  45.06 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  45.06 
 
 		 195 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  45.68 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  45.06 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  44.16 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  47.44 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  41.95 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  41.36 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  44.16 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  47.46 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  44.38 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  44.17 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  47.46 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  44.44 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  43.04 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  38.22 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  46.25 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  38.22 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  47.52 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  44.72 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  44.16 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  38.51 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  41.21 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  46.88 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  42.29 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  38.51 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  42.02 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  47.5 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  47.5 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  47.5 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  42.77 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  47.5 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  42.77 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  42.14 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  42.5 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  43.48 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  39.36 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  47.4 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  39.43 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  36.94 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  47.4 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  41.71 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  38.86 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  47.4 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  44.44 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  45.06 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  45.81 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  42.21 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  46.25 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  44.52 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  41.71 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  46.25 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  46.25 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  35.35 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  42.31 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  40.43 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  37.71 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  42.07 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  41.84 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  41.61 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  46.1 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.17 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  43.48 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>