More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3747 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 344 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  60.28 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  56.62 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  55.05 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  57.06 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  54.1 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  55.56 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  52.98 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  47.91 
 
 		 370 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  56.07 
 
 		 317 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  55.95 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  50.15 
 
 		 332 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  57.49 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  59.67 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  51.65 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  48.99 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  51.5 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  44.34 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  49.54 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  55.62 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  51.14 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  48.79 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  46.94 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.2 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  47.32 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  45.81 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  41.69 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 318 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 318 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 318 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  41.69 
 
 		 361 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  45.18 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  41.12 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.95 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  39.02 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.68 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  36.94 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  35.98 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  42.51 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.87 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.98 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  39.3 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.09 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.53 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  32.73 
 
 		 314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.65 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  27.05 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  36.08 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  33.62 
 
 		 346 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.98 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  28.14 
 
 		 348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  33.9 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  34.71 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  31.29 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.2 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  27.71 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.05 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  43.32 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  42.96 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  29.33 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  32.92 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  27.94 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 		 329 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.26 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.92 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  32.64 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  36.43 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.3 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  29.06 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.52 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.1 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  29.9 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  35.01 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>