More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3683 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  100 
 
 		 329 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  71.38 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  50.81 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  52.47 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  44.81 
 
 		 299 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  46.55 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  45.25 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  45.63 
 
 		 299 aa  212  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  47.67 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  47.27 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  49.8 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  45.19 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  41.61 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  46.24 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  40.45 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.93 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.72 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  39.2 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  38.89 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  44.06 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  38.38 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  39.07 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  38.93 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  39.2 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  40.88 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  34.35 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  38.54 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  37.54 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  34.29 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  33.33 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  39.16 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  39.16 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  39.16 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.9 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  33.57 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  34.04 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  32.12 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  36.82 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  33.69 
 
 		 281 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.92 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  32.38 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  34.18 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  41.67 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.9 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  32.79 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  33.65 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.6 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.43 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  37.96 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  35.15 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  33.45 
 
 		 280 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.69 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  35.23 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.11 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.25 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  33.81 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  31.73 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.73 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  32.18 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.25 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  31.1 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  32.54 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  33.92 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  33.44 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  34.9 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  34.04 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  32.87 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  37.18 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  30.82 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  30.59 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  37.88 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  46.52 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  31.34 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  28.78 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  31.34 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  29.62 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  31.41 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.23 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  32.74 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  33.57 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  53.85 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.76 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  28.28 
 
 		 269 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  32.75 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  51 
 
 		 272 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  29.76 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  31.37 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  32.38 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  32.38 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.75 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  32.38 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  32.66 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.46 
 
 		 918 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>