More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3538 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 433 aa  832    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  80.75 
 
 		 438 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  54.19 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  54.21 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  41.09 
 
 		 415 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40.19 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  46.7 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  41.32 
 
 		 411 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.57 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.94 
 
 		 413 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.62 
 
 		 413 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  42.76 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  42.02 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  42.51 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.98 
 
 		 425 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  42.18 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  40.28 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  44.66 
 
 		 420 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.95 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  41.91 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  39.38 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  37.26 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.62 
 
 		 431 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  40.76 
 
 		 416 aa  266  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  35.7 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.2 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  42.82 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.37 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  44.42 
 
 		 423 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  40.28 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  37.59 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.2 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.69 
 
 		 406 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  39.45 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  40.28 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  38.96 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.35 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.45 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.21 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  39.21 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.21 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.21 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  43.19 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  39.21 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  38.71 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  41.57 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.71 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  38.96 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.94 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35.92 
 
 		 415 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.68 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  41.57 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  34.29 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.59 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.29 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.47 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  35.95 
 
 		 418 aa  242  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  40.29 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  40.34 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  37.24 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  42.49 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 417 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  40.64 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  36.01 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  39.86 
 
 		 413 aa  230  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.13 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  39.23 
 
 		 413 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  39.15 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.57 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.32 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  31.89 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  36.38 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  33.89 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  39.32 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  35.56 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  34.52 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  34.67 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  34.67 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  38.26 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.12 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.12 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  38.94 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.2 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  35.25 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  34.92 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  34.27 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  37.1 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  34.27 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  34.68 
 
 		 424 aa  209  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  33.96 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  32.54 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  36.75 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  29.52 
 
 		 401 aa  206  9e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>