More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3486 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  873    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  72.22 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 442 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  46.36 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  44.7 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  43.2 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.38 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 419 aa  266  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 419 aa  266  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  43.96 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  43.26 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  44.63 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  43.12 
 
 		 418 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  39.54 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 418 aa  256  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 450 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 416 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  43.6 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 476 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 426 aa  243  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 474 aa  237  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 494 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 509 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  36 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  33.67 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  37.13 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 413 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  33.95 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 475 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  34.59 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 419 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  36.78 
 
 		 431 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  30.89 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  34.35 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  31.1 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 413 aa  190  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  34.86 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>