More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3449 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
1056 aa  2031  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  38.13 
 
 
934 aa  408  1e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
911 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.39 
 
 
963 aa  340  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  34.88 
 
 
829 aa  328  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  34.22 
 
 
900 aa  320  8e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.48 
 
 
1068 aa  317  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  34.41 
 
 
859 aa  313  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.13 
 
 
897 aa  303  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
1262 aa  302  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 
1185 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.43 
 
 
992 aa  294  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.94 
 
 
1039 aa  292  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
1288 aa  291  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
785 aa  290  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
1050 aa  287  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
1105 aa  285  5e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.82587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.94 
 
 
801 aa  284  6e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.03 
 
 
1000 aa  275  4e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 
1324 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 
1424 aa  266  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
1128 aa  266  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  35.56 
 
 
675 aa  264  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  28.39 
 
 
1314 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.44 
 
 
899 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  30.05 
 
 
845 aa  250  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.6 
 
 
1309 aa  250  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.64 
 
 
1131 aa  233  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  29.06 
 
 
849 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.58 
 
 
1328 aa  228  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
924 aa  228  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  43.41 
 
 
385 aa  227  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
454 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.66 
 
 
713 aa  224  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  33.26 
 
 
1488 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  28.93 
 
 
843 aa  220  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.24 
 
 
771 aa  218  3e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  29.84 
 
 
838 aa  218  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 
787 aa  218  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.94 
 
 
1186 aa  216  1e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
1215 aa  214  5e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  28.66 
 
 
1500 aa  214  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
1088 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.73 
 
 
885 aa  201  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
1283 aa  198  5e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.1 
 
 
828 aa  197  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  27.16 
 
 
1010 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.54 
 
 
1523 aa  195  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  27.48 
 
 
1509 aa  194  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
1125 aa  194  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  32.35 
 
 
1468 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.34 
 
 
1383 aa  184  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.05 
 
 
767 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  35.76 
 
 
825 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
857 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
1146 aa  181  6e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  42.04 
 
 
373 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.05 
 
 
1311 aa  177  1e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
568 aa  175  4e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.06 
 
 
568 aa  175  4e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  26.85 
 
 
793 aa  172  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 
991 aa  167  1e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 
284 aa  165  4e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
837 aa  165  4e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.39 
 
 
2145 aa  160  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.48 
 
 
1040 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 
751 aa  158  5e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
1136 aa  157  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
776 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.3 
 
 
1550 aa  155  6e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  30.78 
 
 
847 aa  153  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
843 aa  150  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  35.42 
 
 
362 aa  150  2e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  32.49 
 
 
457 aa  149  2e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.7 
 
 
1212 aa  149  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.79 
 
 
1261 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.48 
 
 
1404 aa  147  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
814 aa  146  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
1290 aa  145  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 
1507 aa  143  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  23.81 
 
 
1044 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 
1475 aa  141  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
953 aa  141  8e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.99 
 
 
493 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 
725 aa  138  6e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
949 aa  136  2e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
686 aa  136  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  32.37 
 
 
919 aa  136  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27.29 
 
 
919 aa  136  2e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
444 aa  135  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 
577 aa  134  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.94 
 
 
672 aa  134  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.29 
 
 
822 aa  129  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  49.33 
 
 
715 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
443 aa  126  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
966 aa  125  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
850 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.32 
 
 
1326 aa  118  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  40.34 
 
 
702 aa  117  1e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  35.98 
 
 
304 aa  117  2e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>