More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3440 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 573 aa  1092    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  59.16 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  59.27 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  57.18 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  57.14 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  52.37 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  44.01 
 
 		 750 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 		 748 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 756 aa  196  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  34.49 
 
 		 715 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  32.05 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 723 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  28.84 
 
 		 767 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 747 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 715 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 715 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  30.02 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 689 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 		 414 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 		 775 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 429 aa  163  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  32.94 
 
 		 683 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 414 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 455 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 460 aa  157  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  28.7 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  27.89 
 
 		 883 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  27.34 
 
 		 951 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  29.61 
 
 		 816 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 		 427 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 423 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.5 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 425 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 406 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 406 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.64 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.49 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.49 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 420 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 412 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 422 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.59 
 
 		 414 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.24 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.65 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.84 
 
 		 375 aa  124  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  23.84 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.84 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.84 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.84 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.84 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.53 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.77 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.46 
 
 		 375 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 		 444 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.79 
 
 		 387 aa  120  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.55 
 
 		 387 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.55 
 
 		 387 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.55 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.55 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.76 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.55 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.55 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.55 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.55 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.11 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 424 aa  117  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 385 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.08 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.16 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.67 
 
 		 386 aa  115  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  23.6 
 
 		 375 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 389 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  23.6 
 
 		 375 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.6 
 
 		 375 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 767 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.84 
 
 		 399 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.68 
 
 		 625 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.68 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 592 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.68 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>