57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3439 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  928    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  35.23 
 
 		 524 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  40.24 
 
 		 358 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  39.47 
 
 		 715 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  41.06 
 
 		 705 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  39.31 
 
 		 1901 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  35.03 
 
 		 157 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  43.31 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 		 785 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 		 911 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  30.91 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  41.21 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  38.04 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  39.16 
 
 		 235 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  38.82 
 
 		 237 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  38.16 
 
 		 238 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  40.27 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.75 
 
 		 1056 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  37.33 
 
 		 266 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  37.93 
 
 		 161 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  36.93 
 
 		 235 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  39.02 
 
 		 934 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  34.83 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  38.1 
 
 		 564 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  39.04 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  43.41 
 
 		 963 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.48 
 
 		 829 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  34.17 
 
 		 1355 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  33.09 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  29.69 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  31.05 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  29.63 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  35.48 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  30.24 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  32.32 
 
 		 899 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1068 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  38.3 
 
 		 751 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  27.45 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  29.52 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  31.68 
 
 		 281 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  28.48 
 
 		 859 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  39.02 
 
 		 241 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.28 
 
 		 897 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  31.91 
 
 		 1309 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6953  hypothetical protein  40.51 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  27.54 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  30.63 
 
 		 992 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  26.25 
 
 		 793 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 		 310 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  25.12 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  27.46 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>