16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3392 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 479 aa  958    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  29.62 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  40.91 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3737  hypothetical protein  47.56 
 
 		 149 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  40.22 
 
 		 345 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  30.41 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  29.95 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  27.49 
 
 		 565 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  29.6 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  29.65 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  24.32 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  23.15 
 
 		 545 aa  47  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  26.05 
 
 		 445 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>