More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3390 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  100 
 
 		 380 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  55.26 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  50.39 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  46.65 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  48.04 
 
 		 371 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  41.18 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  40.54 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  39.01 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  33.42 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  31.25 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  29.97 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  30.56 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.75 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.25 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.19 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.18 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.29 
 
 		 477 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 194 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.27 
 
 		 400 aa  89.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.03 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.42 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.06 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.73 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  26.84 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.14 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.08 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.83 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.46 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.85 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.7 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  22.29 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.92 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  29.52 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.59 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.78 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0749  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.25 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.43 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  28.57 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  26.27 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  20.9 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.93 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.93 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.32 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.47 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  26.61 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  26.59 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.78 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  34.38 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  34.38 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.85 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.66 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.03 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.45 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.47 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.03 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.85 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.31 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.47 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.2 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  29.73 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.54 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.01 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.83 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.74 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.83 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.85 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.6 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.36 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.05 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.27 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.71 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.71 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.16 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  23.96 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  22.56 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.65 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  21.47 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  32.26 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  22.7 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.25 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.02 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.95 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  23.51 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.94 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  21.22 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.27 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>