257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3380 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  64.62 
 
 		 212 aa  291  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  64.15 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  64.15 
 
 		 211 aa  287  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  65.09 
 
 		 212 aa  287  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  69.67 
 
 		 209 aa  287  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  64.62 
 
 		 210 aa  284  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  65.09 
 
 		 210 aa  284  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  66.35 
 
 		 210 aa  283  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  64.76 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  63.21 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  63.01 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  65.88 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  63.03 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  60.66 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  63.68 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  60.66 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  63.03 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  63.03 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  63.03 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  63.03 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  63.03 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  63.03 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  62.26 
 
 		 210 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  62.86 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  60.19 
 
 		 210 aa  271  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  62.26 
 
 		 210 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  65.4 
 
 		 211 aa  270  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  63.21 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  60.59 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  62.74 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  60.66 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  60.19 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  66.35 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  60.19 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  60.19 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  60.19 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  60.19 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  62.26 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  62.2 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  64.32 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  58.99 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  61.32 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  63.85 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  59.72 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  66.04 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  62.15 
 
 		 212 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  63.64 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  63.21 
 
 		 210 aa  257  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  57.75 
 
 		 210 aa  257  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  65.4 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  62.09 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  61.68 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  66.35 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  61.32 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  60.95 
 
 		 210 aa  254  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  59.43 
 
 		 211 aa  254  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  57.14 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  59.81 
 
 		 215 aa  254  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  57.75 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  60.93 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  53.46 
 
 		 216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  59.82 
 
 		 224 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  63.51 
 
 		 210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  59.62 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  55.78 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  43.28 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  39.21 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  34.68 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.1 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  33.63 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  35 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  31.75 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  31.78 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  36.2 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  31.06 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.06 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  31.42 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  30.8 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.91 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  30.21 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.42 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  31.06 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  31.97 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  30.51 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  30.51 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  30.64 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  33.2 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  29.15 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>