98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3320 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  31.68 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.72 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.86 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.65 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.48 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.82 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.11 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0508  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.37 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  27.11 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  27.73 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.32 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  33.13 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  20.78 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.68 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  24.62 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.49 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  27.04 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1295  hypothetical protein  28.29 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00733606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  38.3 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.66 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  29.9 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.08 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.54 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.82 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  23.28 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  25.98 
 
 		 397 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 330 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.98 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  26.42 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  21.43 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  20.62 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  25.54 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  31.58 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1691  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  33.57 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  24.54 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  22.43 
 
 		 402 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2330  hypothetical protein  36.52 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000212255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3616  hypothetical protein  33.91 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3998  hypothetical protein  36.44 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.029016  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.61 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  24.64 
 
 		 408 aa  45.4  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  24.43 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  33.04 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  46.34 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  33.03 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1606  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  32.17 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3897  alpha/beta hydrolase  32.61 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  36.13 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  29.93 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.91 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  24.09 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.65 
 
 		 631 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  26.7 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1245  hypothetical protein  32.64 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.06 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  25.19 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0913  alpha/beta superfamily-like hydrolase  32.79 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.86 
 
 		 467 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  25.59 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  30.7 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  23.83 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  27.18 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  33.04 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  32.17 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  30.58 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  32.23 
 
 		 346 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.17 
 
 		 284 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  43.9 
 
 		 316 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.56 
 
 		 295 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  28.11 
 
 		 247 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  33.33 
 
 		 251 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 307 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.17 
 
 		 284 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.17 
 
 		 284 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.17 
 
 		 284 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 251 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>