273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3313 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  100 
 
 
409 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  100 
 
 
433 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  72.16 
 
 
310 aa  346  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 
395 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  41.89 
 
 
390 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  41.89 
 
 
390 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  41.89 
 
 
390 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  36.52 
 
 
437 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  36.6 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  35.51 
 
 
396 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  35.51 
 
 
396 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  35.51 
 
 
396 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  35.51 
 
 
396 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  35.51 
 
 
396 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  36.08 
 
 
483 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 
395 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  35.51 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  34.01 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  32.99 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  33.89 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  33.7 
 
 
367 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  32.07 
 
 
401 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  32.07 
 
 
401 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
366 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  37.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  36.86 
 
 
331 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  27.75 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  29.78 
 
 
372 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  29.78 
 
 
372 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  29.78 
 
 
372 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  26.1 
 
 
374 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  26.1 
 
 
374 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  26.09 
 
 
374 aa  117  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  26.1 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  29.7 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5832  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5401  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  26.7 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  26.88 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  25.59 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  25.59 
 
 
377 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>