177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3285 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3285  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00212969  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1438  K transporting ATPase KdpC subunit  57.24 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5031  K transporting ATPase KdpC subunit  61.99 
 
 		 288 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0602  K transporting ATPase KdpC subunit  66.44 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0435  K+-transporting ATPase c chain-like protein  63.39 
 
 		 290 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4761  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  61.51 
 
 		 285 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4228  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  60.74 
 
 		 289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4294  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  60.74 
 
 		 289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4606  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  60.07 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6789  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.93 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.160019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27040  K+-transporting ATPase, C subunit  64.47 
 
 		 222 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  52.58 
 
 		 189 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 		 205 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  66.2 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  54.65 
 
 		 192 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1018  potassium-transporting ATPase, C subunit  68.57 
 
 		 196 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.54573  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3780  potassium-transporting ATPase, C subunit  66.67 
 
 		 227 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  58.54 
 
 		 193 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.69 
 
 		 194 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4090  Potassium-transporting ATPase  62.86 
 
 		 210 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  53.85 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  58.44 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  60.81 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  56.63 
 
 		 192 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  61.54 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  60.49 
 
 		 201 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.25 
 
 		 190 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  53.26 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  60.53 
 
 		 193 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  60.27 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1512  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.14 
 
 		 203 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  57.89 
 
 		 191 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.41 
 
 		 193 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  64.79 
 
 		 189 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.89 
 
 		 209 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  59.21 
 
 		 191 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  55.95 
 
 		 193 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  61.54 
 
 		 193 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  61.54 
 
 		 193 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  63.38 
 
 		 811 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  34.97 
 
 		 198 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  59.21 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  64.38 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  56 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  62.86 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  61.54 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3229  Potassium-transporting ATPase  59.46 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.11 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  54.76 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  59.72 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  62.5 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  59.72 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.58 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  53.57 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  43.22 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  61.11 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  51.85 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.14 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.32 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1877  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.03 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.571443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.75 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.33 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  55.26 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  57.75 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.33 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1679  Potassium-transporting ATPase  55.56 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3614  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.66 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  hitchhiker  0.000228688 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0204  potassium-transporting ATPase subunit C  55.88 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  53.25 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  54.67 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  52.5 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  49.33 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  55.13 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  50.7 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.13 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.1 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  54.17 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  50.67 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.52 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  55.88 
 
 		 202 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  58.46 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  57.75 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  54.29 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  54.29 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>