More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3258 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  100 
 
 
725 aa  1431    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  47.48 
 
 
675 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  38.37 
 
 
690 aa  359  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  36.74 
 
 
711 aa  350  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  35.66 
 
 
720 aa  334  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  38.09 
 
 
675 aa  333  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  36.02 
 
 
681 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  36.29 
 
 
718 aa  326  8.000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  36.36 
 
 
726 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  36.36 
 
 
726 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  36.36 
 
 
726 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  35.62 
 
 
679 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  36.7 
 
 
682 aa  312  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  34.48 
 
 
777 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  37.18 
 
 
685 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0643  acyltransferase 3  35.31 
 
 
693 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  32.71 
 
 
690 aa  300  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  33.68 
 
 
675 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  33.57 
 
 
688 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  33.67 
 
 
676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  32.2 
 
 
715 aa  278  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2881  acyltransferase 3  31.79 
 
 
684 aa  276  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  34.06 
 
 
646 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2880  acyltransferase 3  31.73 
 
 
681 aa  264  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.985615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  29.76 
 
 
675 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  33.81 
 
 
675 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  32.11 
 
 
742 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.45 
 
 
716 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.95 
 
 
710 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.95 
 
 
710 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2589  acyltransferase 3  30.72 
 
 
696 aa  248  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2588  acyltransferase 3  31.39 
 
 
681 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000354486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  32.1 
 
 
734 aa  241  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  47.15 
 
 
720 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.02 
 
 
662 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.78 
 
 
675 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4381  acyltransferase 3  31.36 
 
 
687 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  30.18 
 
 
695 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.77 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  30.03 
 
 
654 aa  210  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  41.41 
 
 
642 aa  210  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.66 
 
 
671 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1170  acyltransferase 3  31.36 
 
 
694 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177695  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.61 
 
 
665 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  42.46 
 
 
630 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.92 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  35.4 
 
 
673 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4330  acyltransferase 3  28.47 
 
 
711 aa  197  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  30.03 
 
 
691 aa  196  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.71 
 
 
690 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.27 
 
 
656 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.38 
 
 
629 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2787  acyltransferase 3  29.93 
 
 
731 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.87 
 
 
695 aa  194  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  36.71 
 
 
643 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.12 
 
 
645 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3630  acyltransferase 3  29.9 
 
 
731 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  35.34 
 
 
667 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3139  acyltransferase 3  29.8 
 
 
716 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3079  acyltransferase 3  29.8 
 
 
716 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3096  acyltransferase 3  29.8 
 
 
716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140051  normal  0.0654687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  39.94 
 
 
662 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.25 
 
 
635 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  26.27 
 
 
690 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26680  predicted acyltransferase  31.25 
 
 
858 aa  187  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  43.02 
 
 
722 aa  187  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.57 
 
 
679 aa  187  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  25.14 
 
 
660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  30.12 
 
 
658 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  31.86 
 
 
684 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.62 
 
 
639 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.53 
 
 
640 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.21 
 
 
660 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.65 
 
 
637 aa  183  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  36.13 
 
 
683 aa  183  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  30.3 
 
 
604 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  30.3 
 
 
604 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  31.7 
 
 
607 aa  182  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  41.71 
 
 
665 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11597  hypothetical protein  28.55 
 
 
729 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  35.47 
 
 
632 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2821  acyltransferase 3  27.46 
 
 
728 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  31.48 
 
 
603 aa  180  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  35.49 
 
 
647 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  31.48 
 
 
603 aa  180  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  29.39 
 
 
645 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3701  acyltransferase 3  28.07 
 
 
728 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.332374  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5338  acyltransferase 3  28.03 
 
 
728 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5673  acyltransferase 3  28.03 
 
 
728 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.411355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  37.67 
 
 
695 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.55 
 
 
638 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2977  acyltransferase 3  27.22 
 
 
751 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  38.4 
 
 
428 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  29.14 
 
 
629 aa  177  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  37.3 
 
 
641 aa  175  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  28.08 
 
 
602 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  25.11 
 
 
657 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  30.85 
 
 
681 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  29.62 
 
 
660 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  30.85 
 
 
681 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>