More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3214 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 896 aa  768    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 898 aa  818    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 875 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  61.92 
 
 		 892 aa  1012    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 902 aa  815    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 867 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 883 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 900 aa  882    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 876 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 893 aa  769    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 888 aa  916    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 878 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 891 aa  878    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 903 aa  796    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 895 aa  864    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 897 aa  744    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 879 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 890 aa  853    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 889 aa  950    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 874 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 889 aa  1025    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 882 aa  666    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 863 aa  646    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 888 aa  939    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 878 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 882 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 897 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 876 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 880 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 895 aa  827    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 863 aa  649    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 876 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 893 aa  828    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 881 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 878 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 881 aa  1748    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 897 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 904 aa  806    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 879 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 879 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 868 aa  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 877 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 884 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 879 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 880 aa  648    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 889 aa  1011    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 897 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 897 aa  821    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 898 aa  832    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 880 aa  691    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  49.6 
 
 		 894 aa  752    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  63.13 
 
 		 890 aa  980    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 878 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 885 aa  836    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 893 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 876 aa  673    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  62.36 
 
 		 889 aa  981    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  83.64 
 
 		 892 aa  1426    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 895 aa  845    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 874 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 878 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 892 aa  1013    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 892 aa  814    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 897 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 885 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 878 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 897 aa  880    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 886 aa  932    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 878 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 896 aa  889    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 879 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 897 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 898 aa  823    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 879 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 890 aa  890    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 876 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 874 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 880 aa  695    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 876 aa  662    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 874 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 875 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 892 aa  635  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 865 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 874 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 876 aa  632  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 863 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 864 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 877 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>