87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3165 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  861    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  70.7 
 
 		 443 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  46.93 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  49.77 
 
 		 454 aa  342  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  47.67 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  48.42 
 
 		 412 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  43.17 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  39.69 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  35.68 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  31.13 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  34.07 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  34.67 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  34.73 
 
 		 449 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  32.83 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  34.51 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  27.97 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  29.64 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  32.4 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  35.09 
 
 		 424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  35.52 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  28.48 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  38.02 
 
 		 429 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  31.69 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  31.24 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  30.27 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  30.94 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  32.59 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  32.22 
 
 		 445 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  30.43 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  31.98 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  26.82 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  30.95 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  31.25 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  28.35 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  28.35 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  26.98 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  26.48 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  24.54 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  29.11 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  24.11 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  25.94 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  26.64 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  29.15 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  27.13 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  25.39 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  25.06 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  25.11 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  27.8 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  25.28 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  26.85 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  24.6 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  25.17 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  27.52 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  24.45 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  24.23 
 
 		 415 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  24.32 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  24.23 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  24.44 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  24.39 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  24.22 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  24.22 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  24.22 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  27.38 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  22.77 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  26.58 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  24.84 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  23.02 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  25.17 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  21.08 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  28.72 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  26.79 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  31.58 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  25.75 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  25.66 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  26.59 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  29.95 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  25.95 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  27.92 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  22.22 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  26.45 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  21.46 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  24.3 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  25.64 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  21.82 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  27.3 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.282654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>