More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3122 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  85.2 
 
 		 395 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  100 
 
 		 407 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  73.88 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  75.39 
 
 		 397 aa  577  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  73.54 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  73.3 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.8 
 
 		 384 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.5 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  73.28 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  70.88 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  72.02 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  69.82 
 
 		 383 aa  553  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  71.24 
 
 		 400 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  54.85 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  57.06 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  57.34 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  56.37 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  50.71 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  55.49 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  57.63 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  50.47 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  53.66 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  54.45 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  55.62 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.48 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  52.79 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  51.45 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  55.43 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  55.43 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  51.73 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  49.86 
 
 		 368 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  51.58 
 
 		 375 aa  348  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  51.27 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  49.72 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  52.39 
 
 		 389 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  50.7 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  49.01 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  48.16 
 
 		 366 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.55 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  48.99 
 
 		 372 aa  296  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.4 
 
 		 377 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  44.88 
 
 		 373 aa  285  8e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.11 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  44.97 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  43.48 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  43.02 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  40.35 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  39.94 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  39.1 
 
 		 346 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  37.03 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  36.56 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.24 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  32.82 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  32.74 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.12 
 
 		 303 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  36.04 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  37.5 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  37.5 
 
 		 334 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  37.21 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.89 
 
 		 324 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.44 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.44 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  36.04 
 
 		 306 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  36.2 
 
 		 327 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  37.91 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.21 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  36.31 
 
 		 324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.01 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  37.24 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  35.14 
 
 		 304 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.01 
 
 		 333 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.99 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.16 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.16 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  36.05 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.64 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  37.2 
 
 		 305 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  36.12 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  36.34 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.99 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  36.72 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  33.24 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  33.73 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  37.01 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  35.17 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  31.76 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  35.54 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.42 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.53 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  34.62 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  35.09 
 
 		 304 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  34.02 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>