More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3112 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  75.56 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  37.8 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  37.98 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.41 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  41.6 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  38.58 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  36.3 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 139 aa  100  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  37.88 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.38 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.38 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.38 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.38 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  31.94 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  33.86 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  41.09 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  38.69 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  38.69 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  44 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  40.48 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  41.27 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  34.35 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  41.48 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1073  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  37.9 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  32.8 
 
 		 151 aa  85.9  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.03 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  37.4 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.03 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.03 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.92 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  36.92 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  35.61 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  38.21 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  34.51 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  35.61 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  35.61 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  34.45 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  31.97 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  34.35 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  29.86 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>