224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3094 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3094  arsenite-transporting ATPase  100 
 
 
404 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.968228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1823  arsenite-transporting ATPase  63.13 
 
 
401 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702579  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3111  arsenite-transporting ATPase  43.64 
 
 
410 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  43.94 
 
 
389 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  40.49 
 
 
409 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2364  arsenite-activated ATPase ArsA  34.17 
 
 
395 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  33.76 
 
 
392 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0213  arsenite-activated ATPase ArsA  33.16 
 
 
392 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.410604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  35.57 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  31.85 
 
 
408 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0253  arsenite-activated ATPase ArsA  32.91 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  32.49 
 
 
394 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  32.83 
 
 
395 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  32.74 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  32.49 
 
 
406 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  32.49 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  32.24 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  32.33 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  31.98 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  34.82 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  31.27 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  39.84 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  31.49 
 
 
405 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1387  Arsenite-transporting ATPase  41.18 
 
 
406 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.517206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  30.48 
 
 
407 aa  210  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  31.49 
 
 
405 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  30.47 
 
 
408 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  33.83 
 
 
396 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  31.49 
 
 
405 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  33.25 
 
 
390 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  33.83 
 
 
396 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  33.5 
 
 
404 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  28.89 
 
 
393 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  31.39 
 
 
395 aa  206  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  30.73 
 
 
400 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  31.23 
 
 
401 aa  202  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  28.32 
 
 
392 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  28.07 
 
 
393 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  31.73 
 
 
394 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3879  arsenite-activated ATPase ArsA  33.42 
 
 
391 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  28.57 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1173  anion-transporting ATPase  32.25 
 
 
396 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.167129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0390  anion-transporting ATPase family protein  28.57 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  28.82 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  29.15 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  31.5 
 
 
395 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  28.89 
 
 
393 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1314  arsenite-activated ATPase (arsA)  34.32 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.735372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  31.27 
 
 
398 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  30.5 
 
 
396 aa  196  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  28.68 
 
 
384 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  30.3 
 
 
397 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  31 
 
 
404 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0091  arsenite-activated ATPase ArsA  30.33 
 
 
402 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.304953  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  28.27 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  29.88 
 
 
397 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  27.05 
 
 
393 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  30.42 
 
 
396 aa  189  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  27.92 
 
 
384 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  30.27 
 
 
395 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  30.37 
 
 
406 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  27.66 
 
 
385 aa  186  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  28.8 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  33.74 
 
 
407 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  25.94 
 
 
385 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  27.73 
 
 
384 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  28.27 
 
 
384 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  26.48 
 
 
397 aa  178  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  26.91 
 
 
433 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  27.52 
 
 
434 aa  167  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  27.59 
 
 
433 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  27.72 
 
 
433 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  26.5 
 
 
434 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  27.36 
 
 
433 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  26.62 
 
 
433 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3546  arsenite-transporting ATPase  31.87 
 
 
430 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.614872  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3279  arsenite-transporting ATPase  30.11 
 
 
421 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3341  arsenite-transporting ATPase  30.11 
 
 
421 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0464361  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3290  arsenite-transporting ATPase  30.11 
 
 
421 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6065  ion transporting ATPase  31.29 
 
 
417 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0875  anion-transporting ATPase  27.07 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0303  anion-transporting ATPase, N-terminus  33.12 
 
 
169 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2965  anion-transporting ATPase  31.61 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12212  hypothetical protein  32.17 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2781  Anion-transporting ATPase  26.5 
 
 
367 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0926  chromosome partitioning ATPase  32.25 
 
 
351 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1243  normal  0.0822651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0302  anion-transporting ATPase, C-terminus  26.63 
 
 
217 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3328  putative ion transporting ATPase  33.99 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3342  chromosome partitioning ATPase  28.75 
 
 
368 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.520413  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  28.8 
 
 
640 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  28.16 
 
 
643 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0892  arsenite-transporting ATPase  23.05 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.449464  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0450  arsenite-transporting ATPase  23 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0025028  hitchhiker  0.000316077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3002  Anion-transporting ATPase  23.7 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  25.08 
 
 
345 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  22.19 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  25.96 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  30.6 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  28.89 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1865  anion ABC transporter ATPase  24.3 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>