42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3091 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  78.05 
 
 		 411 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  100 
 
 		 414 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  62.02 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  57.66 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  41.4 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  44.75 
 
 		 405 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  40.79 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  39.46 
 
 		 409 aa  308  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  40.29 
 
 		 409 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  38.46 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  38.46 
 
 		 415 aa  299  7e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  38.71 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  38.71 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  40.85 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.71 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  35.94 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  38.24 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  38.88 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.12 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  37.35 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  36.08 
 
 		 703 aa  266  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.32 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  35.11 
 
 		 703 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.65 
 
 		 419 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.75 
 
 		 705 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.41 
 
 		 704 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.21 
 
 		 705 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.51 
 
 		 705 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  34.14 
 
 		 703 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  32.07 
 
 		 372 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  31.68 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  43.32 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  33.8 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  32.91 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  32.75 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  31.53 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  32.46 
 
 		 364 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  31.7 
 
 		 365 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  30.64 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  28.44 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  29.38 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  22.13 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>