More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3066 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  100 
 
 
363 aa  723  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  53.09 
 
 
327 aa  327  1e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  46.95 
 
 
348 aa  274  1e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  45.59 
 
 
368 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  41.64 
 
 
332 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  40.72 
 
 
339 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  38.08 
 
 
351 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  40.68 
 
 
337 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 
346 aa  196  4e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.06 
 
 
346 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 
325 aa  147  4e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
323 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  33.23 
 
 
366 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
332 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  27.66 
 
 
328 aa  130  4e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
324 aa  128  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 
324 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30.98 
 
 
331 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
320 aa  120  4e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
324 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 
325 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
322 aa  115  1e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
329 aa  115  2e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 
322 aa  115  2e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 
350 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
324 aa  114  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
355 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
354 aa  112  1e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
314 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  32.12 
 
 
334 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 
323 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 
352 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
310 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
331 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  27.25 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
862 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.5 
 
 
213 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
337 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
400 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  28.57 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
288 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  27.96 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.91 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  29.35 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  28.62 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
321 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.82 
 
 
354 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.02 
 
 
352 aa  85.9  1e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 
356 aa  84.3  3e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  32.42 
 
 
374 aa  84  4e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
340 aa  84  4e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 
330 aa  84  4e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
335 aa  83.6  5e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
324 aa  83.2  6e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  28.67 
 
 
354 aa  82.8  8e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 
365 aa  81.3  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.38 
 
 
354 aa  80.9  3e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
359 aa  80.9  3e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
359 aa  80.9  3e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  28.27 
 
 
354 aa  80.9  4e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  24.91 
 
 
317 aa  80.5  5e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  27.4 
 
 
359 aa  79.7  7e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
317 aa  79  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
336 aa  79  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  24.91 
 
 
317 aa  78.2  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
354 aa  78.6  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  28.39 
 
 
358 aa  78.2  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.58 
 
 
317 aa  77.8  3e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
365 aa  77.8  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  31.7 
 
 
341 aa  77.8  3e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.58 
 
 
317 aa  77.8  3e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
357 aa  77.4  4e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  24.55 
 
 
317 aa  77  5e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
297 aa  77  5e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
383 aa  77  5e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  28.31 
 
 
349 aa  76.6  6e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
359 aa  76.6  6e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
359 aa  76.6  6e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
359 aa  76.6  6e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
307 aa  76.6  6e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
359 aa  76.6  6e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.22 
 
 
211 aa  76.3  7e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
371 aa  76.6  7e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
361 aa  76.3  7e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
359 aa  76.3  7e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
307 aa  76.3  7e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.28 
 
 
357 aa  76.3  8e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
340 aa  76.3  8e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 
359 aa  76.3  9e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
336 aa  75.5  1e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>