224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2974 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 248 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  48.29 
 
 		 204 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  48.29 
 
 		 539 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  44.58 
 
 		 541 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  46.15 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  48.54 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  47.13 
 
 		 531 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  45.12 
 
 		 553 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  45.38 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  41.37 
 
 		 549 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  44.64 
 
 		 536 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  44.12 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  45.11 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  42.06 
 
 		 534 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  44.26 
 
 		 518 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  45.49 
 
 		 204 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  42.06 
 
 		 539 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  47.7 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  41.28 
 
 		 522 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  44.74 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  43.1 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  43.1 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  43.1 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  42.97 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  44.87 
 
 		 539 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  42.15 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  44.87 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  45.87 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  58.82 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  45.62 
 
 		 571 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  43.59 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  43.51 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  58.73 
 
 		 564 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  40.24 
 
 		 555 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  41.1 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  41.25 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  42.13 
 
 		 562 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  40.59 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  39.18 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  53.44 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  38.56 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  55.91 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  38.14 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  29.75 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  38.96 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  56.1 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  55.12 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  39.15 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  56.69 
 
 		 510 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  59.65 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  49.62 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  39.58 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  58.4 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  39.58 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  39.58 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.58 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  39.83 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  39.58 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  33.89 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  46.94 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.58 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  40.49 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  40.49 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  40.49 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  41.01 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  44.08 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  40.08 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  39.68 
 
 		 218 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  50.37 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  39.37 
 
 		 592 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  49.63 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  40.49 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  50.37 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  50.37 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  50.37 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  49.62 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  38.27 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  55.28 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  34.16 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  30.33 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  41.92 
 
 		 585 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  48.85 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  36.89 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  48.09 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  34.43 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  31.56 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  37.76 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  46.32 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  38.43 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  46.46 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  50.38 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  36.65 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  48.09 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  39.44 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  48.09 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>