70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2933 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
218 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  40.7 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  30.37 
 
 
289 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  32.11 
 
 
302 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
281 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  32.52 
 
 
283 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  33.87 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  28.42 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28.33 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  29.33 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  27.23 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  26.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  32.07 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.33 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  28.33 
 
 
196 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  27.78 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  27.78 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  29.95 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  32.97 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  26.11 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  33.33 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  30.32 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.5 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  30.61 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  34.54 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  28.21 
 
 
296 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  26.6 
 
 
301 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  31.87 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  30.81 
 
 
265 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  28.99 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  30.65 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.6 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  29.8 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  30.54 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.78 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  32.78 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  32.78 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  30.65 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  29.72 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  28.99 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  28.06 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  29.53 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  28.12 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  28.71 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  30.17 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  28.06 
 
 
326 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  31.22 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  29.08 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  27.41 
 
 
143 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  30.65 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  28.19 
 
 
281 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  29.14 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  30.72 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2000  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.91 
 
 
243 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  27 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  30.29 
 
 
256 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  26.13 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  30 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  29.15 
 
 
307 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  30.41 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  23.15 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  26.63 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  26.02 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  29.3 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  32.32 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  23.91 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  28 
 
 
284 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>