More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2905 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2905  aldo/keto reductase  100 
 
 		 329 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789445  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2308  aldo/keto reductase  70.14 
 
 		 373 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12321  hypothetical protein  54.98 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0589  aldo/keto reductase  59.57 
 
 		 322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.460548  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0716  aldo/keto reductase  52.08 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.93631  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  40 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  39.74 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0494  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0026  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4579  aldo/keto reductase  37 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0644  aldo/keto reductase  36.86 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282625  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3927  aldo/keto reductase  36.31 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.124161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  37.75 
 
 		 319 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  34.65 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1670  aldo/keto reductase  37.25 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0804  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0458  aldo/keto reductase  34.56 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0654121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  34.11 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  36.9 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  39.61 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0492  aldo/keto reductase  37.78 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.339705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  34.41 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  32.78 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  35.27 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  32.4 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  36.45 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  32.23 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  32.33 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  36.1 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  35.96 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  36.3 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  33.85 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  34.43 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  35.31 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  34.39 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  36.12 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  31.6 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2010  aryl-alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  35.2 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  35.02 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  34.07 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  32.67 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  33.96 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  36.66 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0136  aldo/keto reductase  35.26 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  34.7 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  35.65 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  32.83 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.13 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  34.34 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  36.4 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_194  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.94 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00647949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0929  aldo/keto reductase  35.51 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0217  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.73 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  34.81 
 
 		 339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  33.86 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  34.47 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  33.01 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  31.61 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  32.93 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  34.58 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  36.16 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  34.87 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  34.11 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2022  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.03 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37723  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01490  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  31.72 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  34.02 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  30.55 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  36.31 
 
 		 491 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  36.57 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  29.58 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  36.68 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  33.13 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  33.76 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.11 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  36.18 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  34.89 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  32 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2380  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.919819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  32 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  33.33 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  33.67 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>