79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2892 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  42.93 
 
 
195 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  42.29 
 
 
199 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  34.12 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.48 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  37.3 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
159 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
145 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  36.67 
 
 
591 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  36.22 
 
 
155 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  34.44 
 
 
697 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
146 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  38.05 
 
 
1039 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.94 
 
 
693 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
143 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.36 
 
 
738 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 
722 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.05 
 
 
142 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 
713 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
122 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 
745 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.65 
 
 
855 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
161 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  35.71 
 
 
282 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
122 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.75 
 
 
1045 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 
171 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  29.82 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
528 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.13 
 
 
613 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.19 
 
 
616 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.17 
 
 
573 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  41.76 
 
 
817 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  30.39 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  29.75 
 
 
771 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
347 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 
1225 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22960  histidine kinase  27.39 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573148  normal  0.329489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 
365 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
121 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.61 
 
 
549 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
164 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0121254  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  27.13 
 
 
470 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  25.87 
 
 
744 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
355 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  34.15 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
135 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 
750 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
134 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  36.17 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.82 
 
 
743 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 
688 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.25 
 
 
952 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
141 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  28.3 
 
 
753 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  30.83 
 
 
805 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
765 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>