More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2843 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 		 445 aa  903    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  85.36 
 
 		 445 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  68.86 
 
 		 440 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.59 
 
 		 461 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  59.68 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  56.82 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  56.15 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.36 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.01 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.02 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  57.91 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.58 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.48 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.85 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.87 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.62 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.69 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  46.59 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  49.07 
 
 		 564 aa  338  8e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  47.56 
 
 		 563 aa  336  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  45.39 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  46.42 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  47.33 
 
 		 416 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  28.94 
 
 		 680 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  34.92 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  34.99 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  35.04 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  34.67 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  37.85 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  34.34 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.49 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  36.53 
 
 		 341 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  37.11 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  37.69 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  33.51 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.47 
 
 		 341 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  33.04 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  34.09 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  37.07 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  36.59 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.78 
 
 		 368 aa  143  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  34.76 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  33.33 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  33.53 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  31.97 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  31.17 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  32.96 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  35.65 
 
 		 340 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  33.9 
 
 		 342 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  34.57 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  37.2 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  30.05 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 351 aa  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 		 343 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  32.62 
 
 		 363 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.52 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  29.19 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  32 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  34.89 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  31.38 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  33.13 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  33.13 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  33.13 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  31.1 
 
 		 365 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  32.28 
 
 		 343 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  32.33 
 
 		 361 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  31.43 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  32 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  30.59 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 		 343 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  32.28 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 		 335 aa  130  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  31.59 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  30.56 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  30.47 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  28.99 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  33.52 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  30.25 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  31.79 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 320 aa  126  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  33.23 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  30.95 
 
 		 319 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  38.4 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  32.3 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  32.93 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  30.31 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  31.32 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  34.35 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  36.05 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 		 322 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  32.85 
 
 		 369 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>