134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2786 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  217  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  76.64 
 
 		 110 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  77.57 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  76.85 
 
 		 113 aa  163  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  76.64 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  78.5 
 
 		 111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  75.7 
 
 		 111 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  77.57 
 
 		 111 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  73.15 
 
 		 110 aa  160  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  74.77 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  75.7 
 
 		 109 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  76.64 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  75.7 
 
 		 110 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  73.83 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  72.9 
 
 		 111 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  70.54 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  76.42 
 
 		 111 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  70.09 
 
 		 111 aa  153  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  73.83 
 
 		 119 aa  153  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  74.11 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  74.11 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  74.11 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  78.5 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  71.03 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  71.96 
 
 		 110 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  70.09 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  71.03 
 
 		 109 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  64.42 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  53.27 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  56.19 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  57.69 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  47.22 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  45.87 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  47.71 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  47.71 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  42.99 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  47.71 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  44.86 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  48.08 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  47.17 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  42.99 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  41.07 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  42.34 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  43.4 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  42.06 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  47.73 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  38.46 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  35.24 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  45.05 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  37.5 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  40.19 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6500  protein of unknown function UPF0060  46.23 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  41.07 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  35.85 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  41.9 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  41.12 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  34.65 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  40.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  40.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  43.27 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  36.45 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  44.55 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  40.86 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  41.9 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  39.81 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  45 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4121  protein of unknown function UPF0060  37.74 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  37.96 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0929  hypothetical protein  46.24 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5886  hypothetical protein  47.31 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  39.81 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  39.81 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  38.24 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  36.79 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0423  hypothetical protein  42.31 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183716  normal  0.508856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  55.17 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0586655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  38.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  38.32 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  40.2 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>