More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2767 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1123    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  45.28 
 
 		 546 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  39.5 
 
 		 535 aa  352  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  39.06 
 
 		 537 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  37.2 
 
 		 542 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  37.11 
 
 		 537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  37.06 
 
 		 541 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  39.46 
 
 		 546 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  39.12 
 
 		 551 aa  333  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 546 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 546 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  38.63 
 
 		 560 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  37.88 
 
 		 532 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  34.91 
 
 		 551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.47 
 
 		 550 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.01 
 
 		 562 aa  263  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  34.35 
 
 		 560 aa  253  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34 
 
 		 542 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  32.98 
 
 		 544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 		 554 aa  233  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  29.4 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.37 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 		 545 aa  209  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  30.46 
 
 		 547 aa  206  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  33.4 
 
 		 524 aa  198  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  31.47 
 
 		 542 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.48 
 
 		 510 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.56 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.84 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.29 
 
 		 521 aa  193  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 539 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.29 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.29 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.29 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  32.05 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.05 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 556 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  29.92 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  27.98 
 
 		 554 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 541 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.46 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 564 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  29.09 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.03 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 528 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 534 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  29.66 
 
 		 550 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.24 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.15 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  28.57 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.29 
 
 		 544 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 607 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.74 
 
 		 535 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.4 
 
 		 541 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.45 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 513 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.75 
 
 		 526 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 528 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.12 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.62 
 
 		 562 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  27.99 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 505 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 528 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.85 
 
 		 550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.43 
 
 		 540 aa  163  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 510 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 504 aa  160  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.45 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.26 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.9 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>