258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2761 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  100 
 
 		 353 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  51.35 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  52.7 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.51 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  49.83 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  49.66 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  48.4 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  44.37 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3116  luciferase family protein  48.68 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878039  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  30.6 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.1 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.74 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.9 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.7 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.12 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  21.8 
 
 		 321 aa  93.2  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  30.52 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.98 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  30.52 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  26.98 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  26.98 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.98 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.8 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  38.3 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  29 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  31.19 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.33 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  29.08 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.3 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.32 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  26.27 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  28.38 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.48 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  27.95 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.41 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.04 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  24.1 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  26.42 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.4 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.56 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  26.73 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  28.18 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.52 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  26.73 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.64 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  29.17 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  26.89 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  31.64 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  25.95 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  27.84 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  27.21 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.81 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  36.54 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.61 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  25.39 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  26.01 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.71 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  35.9 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  42.99 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.76 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.26 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  34.03 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  34.03 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  34.03 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.47 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  32.34 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.29 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.03 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  33.55 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  27.36 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  32.46 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  25.18 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  33.54 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.74 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.63 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.04 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  25.85 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  25.85 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  25.9 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13110  oxidoreductase  30.91 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  31.13 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  31.56 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>